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Javaソースコード読み込み機能で、クラス図は作成されないのですか?

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ソースコード読み込み時にはパッケージやクラスのモデルが自動作成されます。
クラス図はソースコード読み込み後に、生成したモデルから自動作成が可能です。構造ツリーのプロジェクトのポップアップメニューより、[クラス図を自動作成する]を選択し、 実行してください。
クラス図を自動生成する

詳細は、クラス図を自動生成する方法をご覧ください。